Seorang biarawati Amerika memulai perjalanan baru ketika ia bergabung dengan sebuah biara terpencil di pedesaan Italia. Namun, sambutan hangatnya dengan cepat berubah menjadi mimpi buruk yang nyata ketika ia menemukan rumah barunya menyimpan rahasia jahat dan kengerian yang tak terkatakan.
Sinopsis Film
Di sebuah biara di Italia, Suster Mary terlihat sedang berdoa dengan penuh kesungguhan. Ia menunggu Ibu Kepala Biara tertidur agar dapat mencuri kunci dari ruang tertentu. Mary berhasil meloloskan diri sampai ke gerbang, namun sayangnya para biarawati lain berhasil menangkapnya dan melukai kakinya hingga patah. Mary terbangun di dalam peti mati dan berteriak meminta pertolongan, tapi tak ada yang mendengar.
Suster muda bernama Cecilia datang ke biara yang sama. Sesampainya di sana, ia disambut oleh Suster Kepala Biara dan diperkenalkan dengan Suster Isabelle yang mengajaknya berkeliling, termasuk memperingatkan bahwa ruang bawah tanah adalah area terlarang. Cecilia juga bertemu dengan teman sekamarnya, Suster Gwen.
Cecilia mengikrarkan janji di bawah pengawasan Kardinal Franco Merola dan Pastor Sal Tedeschi. Saat acara penyambutan, Cecilia bercerita kepada Tedeschi tentang pengalamannya selamat dari tenggelam di danau beku, dimana jantungnya berhenti selama tujuh menit. Tedeschi menafsirkan kejadian itu sebagai tanda bahwa Cecilia dipilih Tuhan untuk sebuah misi penting.
Pada hari yang sama, Cecilia melihat sosok biarawati berjubah hitam dengan topeng yang tergeletak tak sadar di depan altar, yang kemudian memperingatkannya agar menjauh. Ketika berbalik, Cecilia dikejutkan dengan hadirnya Suster Kepala Biara. Kepala Biara menunjukkan sebuah paku yang konon pernah digunakan untuk menyalib Yesus. Namun, tiba-tiba beberapa tangan muncul dari balik bilik dan menarik Cecilia. Ia dikejar oleh biarawati bermasker yang hendak menusuknya dengan paku. Cecilia kemudian terbangun, menyadari itu hanyalah mimpi buruk.
Cecilia mulai melaksanakan tugasnya dengan merawat para lansia dan mengurus jenazah. Ia juga melakukan tugas menyembelih ayam untuk konsumsi biara.
Namun, saat mandi, Cecilia muntah-muntah dan diperiksa oleh tim medis serta diinterogasi oleh Merola dan Tedeschi. Hasil pemeriksaan menunjukkan bahwa Cecilia hamil secara ajaib, meski ia masih perawan. Kondisi ini membuat para biarawati mulai menganggapnya sebagai perwujudan Bunda Maria dan memujanya. Namun, Cecilia merasa beban ini sangat berat dan menekan dirinya.
Pada trimester kedua, Suster Isabelle mencoba menenggelamkan Cecilia ketika sedang berendam, tapi berhasil dihentikan oleh beberapa biarawati lain. Isabelle marah karena merasa dirinya yang seharusnya dipilih, lalu meminta tes ulang. Beberapa waktu kemudian, Isabelle bunuh diri dengan meloncat dari atap.
Setelah kejadian itu, Suster Gwen mulai mempertanyakan misteri di balik biara dan mengkritik kondisi yang ada, tapi para biarawati lain mencoba membungkamnya.
Suatu malam, Cecilia menemukan Gwen terikat di kursi dengan lidahnya dipotong sebagai hukuman karena memberontak. Cecilia juga menemukan ruang bawah tanah yang berisi toples-toples berisi janin manusia.
Suatu pagi, Cecilia terjatuh dan berlumuran darah. Para biarawati menduga ia mengalami masalah serius terkait kehamilannya. Tedeschi membawanya ke rumah sakit, tapi ternyata darah yang ditemukan adalah darah ayam hasil sembelihan Cecilia. Cecilia yang sadar direncanakan akan dijebak itu berusaha kabur, tapi tertangkap dan kakinya dicap dengan besi panas bertanda salib untuk mencegah pelarian.
Tedeschi kemudian mengungkapkan bahwa laboratorium bawah tanah digunakan untuk percobaan menciptakan kedatangan Kristus kedua dengan menggunakan DNA dari paku salib dan memilih seorang perawan sebagai ibu. Janin-janin dalam toples adalah hasil percobaan yang gagal. Tedeschi percaya bahwa Cecilia adalah terpilih berdasarkan pengalaman ajaibnya.
Pada trimester ketiga, Cecilia mulai menyadari bahwa anak yang dikandungnya bisa menjadi mesias atau malah antikristus. Saat pemeriksaan USG oleh Kepala Biara, Cecilia menyerang dan melarikan diri. Ia mencekik Kardinal Merola dengan rosario hingga tewas. Air ketubannya pecah, dan Cecilia menuju laboratorium Tedeschi, membakar tempat itu dengan cairan etanol.
Tedeschi mencoba menghentikan Cecilia dan menyerangnya dengan pisau bedah untuk mengeluarkan bayi dari kandungannya, namun Cecilia menusuk tenggorokan Tedeschi dengan paku hingga tewas.
Cecilia berlari keluar biara dan berteriak kesakitan saat melahirkan. Ia menggigit tali pusar bayinya, dan bayi tersebut mengeluarkan suara aneh seperti makhluk bukan manusia. Cecilia kemudian mengambil batu besar dan menghujamkannya ke bayi itu.